这个和是否个人主体无关，企业主体也是一样的。

开启服务器配置，官方会把所有用户和公众号的交互都推送到你们的服务器，交给你们自己服务器处理，所以官方后台就不让管理自定义菜单等功能了，以免和你们自己服务器的设置冲突。

建议解决方案：

方案1，停用服务器配置。

方案2：继续使用服务器配置，同时把公众号授权给其他第三方平台，在其他第三方平台管理自定义菜单和自动回复等内容；此时第三方平台可以和你们自己的服务器同时管理公众号。